Sunview® Gelred 核酸染料(10000× 水溶液)

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Sunview® Gelred 核酸染料(10000× 水溶液)

价格: 500.00~1800.00
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ND002-01/02/03
0.5ml 1ml 2ml

Sunview® Gelred 核酸染料(10000× 水溶液)

贮藏条件

低温运输,4℃避光保存两年

产品简介

GelRed是一种油性大分子,通过荧光共振能量转移FRET的独特设计改善了同类产品对大片段DNA条带拖尾模糊的现象,带形清晰整齐, 迁移率好, 定量准确, 染色均匀, 灵敏度高, 稳定性高,分子量>1000。

产品特点

1. 条带美观:条带清晰整齐美观。

2.  相对安全:独特油性大分子(分子量>1000)使其不易穿透活细胞膜进入细胞,大分子的染料远超过DNA双螺旋间的尺寸,使其难以插入DNA双链内从而可能引起突变。

3. 迁移率好:EB小分子很快跑出胶外,所以EB容易导致小DNA片段看不清,大分子Sunview® Gelred改善了这一缺点。

4. 染色均匀:整个凝胶负极端和正极端的亮度一样。EB会导致胶的整体背景高发白,经常出现阴阳背景(胶的背景一部分亮一部分暗);长时间/长距离的电泳,EB信号强度会相应下降, 我们的大分子Sunview® Gelred克服这一点。

5. 灵敏度高:亮度高灵敏度高于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响小于SYBR Green。

6. 稳定性高:耐热,可加在缓冲液里,100℃溶解凝胶,防止染色剂没充分混匀。适用于微波或其它加热方法制备琼脂糖凝胶。

7.耐光性强:实验室的日常环境下可以常温放置24个月以上(不能太阳光照射和紫外灯照射)。

8.信噪比好:样品荧光信号强,背景信号低。

9.操作简单:与EB用法完全一样,在预制胶和电泳过程中染料不降解;而电泳后染色过程也只需30 分钟且无需脱色或冲洗。

10. 应用范围:核酸染料、核酸检测:适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于dsDNA、ssDNA 或RNA 染色。

11.兼容性好:Sunview® Gelred适合紫外凝胶透射仪;SafeGreen适合蓝光仪和可见光仪器。Sunview® Gelred与EB有相近的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置:标准的EB滤光片或SYBR滤光片都适用,使用和EB相同紫外凝胶透射仪,在300nm紫外光附近可得到最佳激发。

使用方法

一.胶染法(预染法,用法EB完全相同)

制胶时加入Sunview® Gelred核酸染料(每100mL琼脂糖溶液中加入10μL Sunview® Gelred原装液即可)。按常规方法电泳。

1. 实验室材料和试剂:

1)实验样品:质粒DNA,DNA marker(国产的DNA marker浓度太高,至少稀释2~3倍后使用)

2)TBE缓冲液配置:10X TBE电泳缓冲液[Tris 107.8146g (890mM),硼酸55.0287g(890mM),EDTA 5.845g(20mM),加NaOH约4g调节pH=8.3;定容1000mL];用ddH2O稀释10倍配制1X TBE电泳缓冲液。

3)TAE缓冲液配置:50X TAE电泳缓冲液[Tris 242g (2M),EDTA 37.2g(100mM),加醋酸约57ml调节pH=8.5;定容1000mL];用ddH2O稀释50倍配制1X TAE电泳缓冲液。

4)溴酚蓝指示剂,1%的西班牙琼脂糖凝胶,电泳仪(130v),移液器(0.5~10ul),凝胶成像仪

2. 实验步骤:

1)制胶:将0.5g琼脂糖溶于50mL 1X TBE电泳缓冲液中,加热至琼脂糖完全融化。将融好的琼脂糖溶液室温放置50℃左右加入5uL的Sunview® Gelred凝胶电泳染料,摇匀。

2)倒胶:将制好的琼脂糖凝胶缓慢倒于制胶托盘内,避免产生气泡。将点样梳子垂直置于电泳胶膜的一端,距离托盘底部约1mm。放置时尽量保持平稳,切勿晃动。

3)置胶:待约30分钟左右胶体充分凝固后,缓慢垂直向上拔起点样梳子,切勿用力过猛。(夏季适当延长凝胶时间)

4)将琼脂糖凝胶放入电泳槽内,加入电泳缓冲液,使电泳缓冲液液面高于凝胶面约1~2mm。

5)将混合溴酚蓝指示剂的DNA样本(1ul溴酚蓝与2ul DNA标本混合)加入到点样孔内。

6)盖上电泳槽盖,开启电源,使DNA从负极移向正极恒压电泳(电压恒定在120~130v之间,一般可选择130V)。

7)当DNA条带距离点样孔约1~2cm后关闭电源,(约30~40分钟)取出凝胶。

8)用 302nm 激发的 UV 凝胶成像系统观察结果。

*注:此方法染色染料用量相对较少。染料加入胶中可直接使用微波炉加热,制好的胶溶液可以在室温下保存直至用完。

优化电泳条件参考事项:

因为EB是插入DNA内部变成一个整体分子,所以不容易出现迁移/弥散的问题,而大分子的Sunview® Gelred与DNA是通过静电吸引非共价结合的,在DNA外面就容易出现条带迁移,特别是大片段DNA!

1) 鉴于Sunview® Gelred的高灵敏性,建议减少DNA的上样量。DNA样品最佳上样量为~100ng/泳道(常规8泳道小胶孔)。

2) 部分国产的DNA marker浓度太高,稀释一倍后使用!目前国产的部分marker是基于EB染料开发的酶切的混合片段,请使用后染法。

3) 更换电泳缓冲液,新配置的电泳液效果好!用TBE缓冲液代替TAE效果更好!

4) 电泳时电压不宜过高,一般不要超过130V。与EB相比,Sunview® Gelred电泳电压要低一些,跑胶的时间长一些。

5) 染料在室温或4℃下避光储存即可;若有沉淀,将染料加热至40~50℃并充分振荡溶解,不影响使用。

6) 由于Sunview® Gelred具有良好的热稳定性,可以在热的琼脂糖溶液中直接添加后充分振荡混匀。Sunview® Gelred也可以加到琼脂糖粉末和电泳缓冲液中,然后用微波炉加热以制备琼脂糖凝胶。

7) 个别客户用3X染料和样品混合后,点样到琼脂糖凝胶中,不推荐这种点样方式!

8) 如果总是看到条带弥散或分离不理想,建议使用电泳后泡染法染胶。

*此胶染法(预染法)不适合预制聚丙烯酰胺凝胶,对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法(后染法)。

 

二.泡染法(后染法)

注意:泡染出现的条带弯曲和拖带的现象与样品的质量和凝胶的浓度有关,并不是染料的问题! 泡染比预染适当提高琼脂糖凝胶浓度约0.2%-0.3%。

1)按照以上常规方法进行电泳。 用于胶回收等高浓度DNA样品强烈推荐泡染法!

2)Sunview® Gelred10,000×储液稀释约10000倍到0.1M NaCl溶液中制成1×染色液。(例如将5μL Sunview® Gelred 核酸染料(10000× 水溶液)原装液加入到50mL 0.1M NaCl溶液中)。

3)将凝胶小心地放入合适的容器中(如聚丙烯容器中)缓慢加入足量的1× 染色液浸没凝胶。室温振荡染色30min左右,最佳染色时间根据凝胶厚度以及琼脂糖浓度不同而略有不同。对于含1%的凝胶,染色时间约30min。

4)用 302nm 激发的紫外凝胶成像系统观察结果。

*注意事项:用泡染法染色时,染料用量较多。3× Sunview® Gelred 染色液室温避光保存,可重复使用3次左右。

三.核酸电泳的PAGE步骤:

1)将TBE制备的凝胶放入电泳槽中,用夹子夹住边缘。

2)用配置凝胶溶液同一批次的5×TBE灌满缓冲液槽。用注射器排除凝胶底部的气泡。

3)用注射器吸取1×TBE冲洗加样孔。将DNA样品和适量的6×凝胶上样缓冲液混合,用微量移液管加入加样孔。

4)将电极与电源相连(正极接下槽),打开电源一般90V;1~8V/cm。进行电泳9h。

5)电泳至标准参照染料迁移至所需位置(一般是电泳到二甲苯完全迁出,溴酚蓝距底边2~3cm停止)。关闭电源,拔掉插头,弃去电泳槽中的电泳液。

6)将凝胶取下来放入,染色皿中,加1X  Sunview® Gelred1X缓冲液中的振荡染色30-60分,放置在紫外检测即可。

*注意事项:PAGE不能用预染或点染的方法;只能用泡染的方法显色,由于聚丙烯酰胺比较致密,染料不容易深入,显色效果没有琼酯糖凝胶好。

 

特别提醒

1) 本公司所有产品仅限于专业人员用于生命科学研究,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅。

2) 本公司所有产品必须由合格专业技术人员操作同时佩戴口罩/手套/实验服并遵守生物实验室安全操作规程